Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NrkQ9R0G8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NrkQ9R0G8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NrkQ9R0G8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NrkQ9R0G8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
NrkQ9R0G8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NrkQ9R0G8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NrkQ9R0G8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NrkQ9R0G8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NrkQ9R0G8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NrkQ9R0G8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NrkQ9R0G8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NrkQ9R0G8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NrkQ9R0G8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NrkQ9R0G8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
NrkQ9R0G8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NrkQ9R0G8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NrkQ9R0G8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NrkQ9R0G8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NrkQ9R0G8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
NrkQ9R0G8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NrkQ9R0G8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NrkQ9R0G8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NrkQ9R0G8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NrkQ9R0G8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NrkQ9R0G8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NrkQ9R0G8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NrkQ9R0G8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NrkQ9R0G8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NrkQ9R0G8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NrkQ9R0G8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NrkQ9R0G8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NrkQ9R0G8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NrkQ9R0G8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NrkQ9R0G8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
NrkQ9R0G8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms