Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms