Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Lamc3Q9R0B6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Lamc3Q9R0B6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Lamc3Q9R0B6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Lamc3Q9R0B6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Lamc3Q9R0B6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Lamc3Q9R0B6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Lamc3Q9R0B6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Lamc3Q9R0B6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Lamc3Q9R0B6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Lamc3Q9R0B6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Lamc3Q9R0B6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Lamc3Q9R0B6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Lamc3Q9R0B6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Lamc3Q9R0B6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Lamc3Q9R0B6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Lamc3Q9R0B6 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Lamc3Q9R0B6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Lamc3Q9R0B6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Lamc3Q9R0B6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Lamc3Q9R0B6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Lamc3Q9R0B6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Lamc3Q9R0B6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Lamc3Q9R0B6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Lamc3Q9R0B6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Lamc3Q9R0B6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Lamc3Q9R0B6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Lamc3Q9R0B6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Lamc3Q9R0B6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Lamc3Q9R0B6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Lamc3Q9R0B6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Lamc3Q9R0B6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Lamc3Q9R0B6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Lamc3Q9R0B6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Lamc3Q9R0B6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Lamc3Q9R0B6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Lamc3Q9R0B6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Lamc3Q9R0B6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Lamc3Q9R0B6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Lamc3Q9R0B6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Lamc3Q9R0B6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Lamc3Q9R0B6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Lamc3Q9R0B6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Lamc3Q9R0B6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Lamc3Q9R0B6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Lamc3Q9R0B6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Lamc3Q9R0B6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Lamc3Q9R0B6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Lamc3Q9R0B6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Lamc3Q9R0B6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Lamc3Q9R0B6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Lamc3Q9R0B6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Lamc3Q9R0B6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Lamc3Q9R0B6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Lamc3Q9R0B6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Lamc3Q9R0B6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Lamc3Q9R0B6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Lamc3Q9R0B6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Lamc3Q9R0B6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Lamc3Q9R0B6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Lamc3Q9R0B6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Lamc3Q9R0B6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Lamc3Q9R0B6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Lamc3Q9R0B6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Lamc3Q9R0B6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Lamc3Q9R0B6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Lamc3Q9R0B6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Lamc3Q9R0B6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Lamc3Q9R0B6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Lamc3Q9R0B6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Lamc3Q9R0B6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Lamc3Q9R0B6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Lamc3Q9R0B6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Lamc3Q9R0B6 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Lamc3Q9R0B6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Lamc3Q9R0B6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Lamc3Q9R0B6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Lamc3Q9R0B6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Lamc3Q9R0B6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Lamc3Q9R0B6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Lamc3Q9R0B6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Lamc3Q9R0B6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Lamc3Q9R0B6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Lamc3Q9R0B6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Lamc3Q9R0B6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Lamc3Q9R0B6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Lamc3Q9R0B6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Lamc3Q9R0B6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Lamc3Q9R0B6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Lamc3Q9R0B6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Lamc3Q9R0B6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Lamc3Q9R0B6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Lamc3Q9R0B6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Lamc3Q9R0B6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Lamc3Q9R0B6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Lamc3Q9R0B6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Lamc3Q9R0B6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Lamc3Q9R0B6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Lamc3Q9R0B6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Lamc3Q9R0B6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms