Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nek3Q9R0A5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Nek3Q9R0A5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms