Protein–RNA interactions for Protein: Q9R061

Nubp2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp2Q9R061 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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