Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh2d3cQ9QZS8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sh2d3cQ9QZS8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sh2d3cQ9QZS8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sh2d3cQ9QZS8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sh2d3cQ9QZS8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sh2d3cQ9QZS8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sh2d3cQ9QZS8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms