Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM3

Clcf1, Cardiotrophin-like cytokine factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcf1Q9QZM3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms