Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nphp1Q9QY53 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nphp1Q9QY53 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms