Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Opn4Q9QXZ9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Opn4Q9QXZ9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Opn4Q9QXZ9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Opn4Q9QXZ9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Opn4Q9QXZ9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Opn4Q9QXZ9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Opn4Q9QXZ9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Opn4Q9QXZ9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Opn4Q9QXZ9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Opn4Q9QXZ9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Opn4Q9QXZ9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Opn4Q9QXZ9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Opn4Q9QXZ9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Opn4Q9QXZ9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Opn4Q9QXZ9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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