Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

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Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Pcsk1nQ9QXV0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pcsk1nQ9QXV0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pcsk1nQ9QXV0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pcsk1nQ9QXV0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pcsk1nQ9QXV0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pcsk1nQ9QXV0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pcsk1nQ9QXV0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Pcsk1nQ9QXV0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pcsk1nQ9QXV0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pcsk1nQ9QXV0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pcsk1nQ9QXV0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pcsk1nQ9QXV0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pcsk1nQ9QXV0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pcsk1nQ9QXV0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pcsk1nQ9QXV0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pcsk1nQ9QXV0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pcsk1nQ9QXV0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pcsk1nQ9QXV0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pcsk1nQ9QXV0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pcsk1nQ9QXV0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pcsk1nQ9QXV0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pcsk1nQ9QXV0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pcsk1nQ9QXV0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pcsk1nQ9QXV0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pcsk1nQ9QXV0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pcsk1nQ9QXV0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pcsk1nQ9QXV0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pcsk1nQ9QXV0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pcsk1nQ9QXV0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pcsk1nQ9QXV0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pcsk1nQ9QXV0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pcsk1nQ9QXV0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pcsk1nQ9QXV0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pcsk1nQ9QXV0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms