Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms