Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tcea2Q9QVN7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tcea2Q9QVN7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tcea2Q9QVN7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tcea2Q9QVN7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tcea2Q9QVN7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tcea2Q9QVN7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms