Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrfQ9JM73 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SrfQ9JM73 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SrfQ9JM73 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SrfQ9JM73 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SrfQ9JM73 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SrfQ9JM73 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SrfQ9JM73 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SrfQ9JM73 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SrfQ9JM73 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrfQ9JM73 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrfQ9JM73 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrfQ9JM73 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrfQ9JM73 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrfQ9JM73 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrfQ9JM73 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrfQ9JM73 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrfQ9JM73 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrfQ9JM73 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrfQ9JM73 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrfQ9JM73 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrfQ9JM73 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrfQ9JM73 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SrfQ9JM73 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SrfQ9JM73 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SrfQ9JM73 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SrfQ9JM73 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SrfQ9JM73 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SrfQ9JM73 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms