Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms