Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY5

Hip1r, Huntingtin-interacting protein 1-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hip1rQ9JKY5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms