Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms