Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms