Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.6 ms