Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT0

Rcl1, RNA 3'-terminal phosphate cyclase-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcl1Q9JJT0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Rcl1Q9JJT0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rcl1Q9JJT0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rcl1Q9JJT0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Rcl1Q9JJT0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcl1Q9JJT0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcl1Q9JJT0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcl1Q9JJT0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcl1Q9JJT0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcl1Q9JJT0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcl1Q9JJT0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcl1Q9JJT0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcl1Q9JJT0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcl1Q9JJT0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcl1Q9JJT0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcl1Q9JJT0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcl1Q9JJT0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcl1Q9JJT0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcl1Q9JJT0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcl1Q9JJT0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcl1Q9JJT0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcl1Q9JJT0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms