Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG4

Ppp1r3f, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3fQ9JIG4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms