Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF0

Prmt1, Protein arginine N-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prmt1Q9JIF0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prmt1Q9JIF0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prmt1Q9JIF0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prmt1Q9JIF0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prmt1Q9JIF0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prmt1Q9JIF0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prmt1Q9JIF0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prmt1Q9JIF0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prmt1Q9JIF0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prmt1Q9JIF0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prmt1Q9JIF0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prmt1Q9JIF0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prmt1Q9JIF0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prmt1Q9JIF0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prmt1Q9JIF0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prmt1Q9JIF0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Prmt1Q9JIF0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prmt1Q9JIF0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prmt1Q9JIF0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Prmt1Q9JIF0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prmt1Q9JIF0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prmt1Q9JIF0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prmt1Q9JIF0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prmt1Q9JIF0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prmt1Q9JIF0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prmt1Q9JIF0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prmt1Q9JIF0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prmt1Q9JIF0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prmt1Q9JIF0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms