Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI60

Lrat, Lecithin retinol acyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LratQ9JI60 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LratQ9JI60 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LratQ9JI60 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LratQ9JI60 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LratQ9JI60 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LratQ9JI60 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LratQ9JI60 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LratQ9JI60 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LratQ9JI60 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LratQ9JI60 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LratQ9JI60 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LratQ9JI60 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LratQ9JI60 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LratQ9JI60 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LratQ9JI60 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LratQ9JI60 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LratQ9JI60 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LratQ9JI60 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LratQ9JI60 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LratQ9JI60 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LratQ9JI60 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LratQ9JI60 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LratQ9JI60 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LratQ9JI60 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LratQ9JI60 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LratQ9JI60 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LratQ9JI60 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LratQ9JI60 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms