Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESC8

Aff4, AF4/FMR2 family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff4Q9ESC8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Aff4Q9ESC8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Aff4Q9ESC8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Aff4Q9ESC8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Aff4Q9ESC8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Aff4Q9ESC8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Aff4Q9ESC8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Aff4Q9ESC8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Aff4Q9ESC8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Aff4Q9ESC8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Aff4Q9ESC8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aff4Q9ESC8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms