Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc4Q9ES56 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trappc4Q9ES56 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trappc4Q9ES56 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trappc4Q9ES56 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trappc4Q9ES56 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc4Q9ES56 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc4Q9ES56 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc4Q9ES56 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc4Q9ES56 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc4Q9ES56 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc4Q9ES56 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc4Q9ES56 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc4Q9ES56 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc4Q9ES56 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc4Q9ES56 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc4Q9ES56 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc4Q9ES56 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc4Q9ES56 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc4Q9ES56 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc4Q9ES56 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc4Q9ES56 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc4Q9ES56 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc4Q9ES56 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc4Q9ES56 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc4Q9ES56 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc4Q9ES56 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms