Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERC3

Sertad3, SERTA domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sertad3Q9ERC3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sertad3Q9ERC3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sertad3Q9ERC3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sertad3Q9ERC3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sertad3Q9ERC3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sertad3Q9ERC3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sertad3Q9ERC3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sertad3Q9ERC3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sertad3Q9ERC3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sertad3Q9ERC3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sertad3Q9ERC3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sertad3Q9ERC3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sertad3Q9ERC3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sertad3Q9ERC3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sertad3Q9ERC3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sertad3Q9ERC3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sertad3Q9ERC3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sertad3Q9ERC3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sertad3Q9ERC3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sertad3Q9ERC3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sertad3Q9ERC3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sertad3Q9ERC3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sertad3Q9ERC3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sertad3Q9ERC3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms