Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms