Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQC0

Chst1, Carbohydrate sulfotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst1Q9EQC0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chst1Q9EQC0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms