Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ52

Vmn1r48, Vomeronasal type-1 receptor 48, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r48Q9EQ52 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r48Q9EQ52 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r48Q9EQ52 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms