Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPS6

Vmn1r171, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r171Q9EPS6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r171Q9EPS6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms