Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPS4

Vmn1r172, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r172Q9EPS4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r172Q9EPS4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r172Q9EPS4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r172Q9EPS4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r172Q9EPS4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r172Q9EPS4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r172Q9EPS4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r172Q9EPS4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r172Q9EPS4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r172Q9EPS4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r172Q9EPS4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r172Q9EPS4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r172Q9EPS4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r172Q9EPS4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r172Q9EPS4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r172Q9EPS4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r172Q9EPS4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r172Q9EPS4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r172Q9EPS4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r172Q9EPS4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r172Q9EPS4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r172Q9EPS4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r172Q9EPS4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r172Q9EPS4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r172Q9EPS4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r172Q9EPS4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r172Q9EPS4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r172Q9EPS4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r172Q9EPS4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r172Q9EPS4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r172Q9EPS4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r172Q9EPS4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms