Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Tlr1Q9EPQ1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Tlr1Q9EPQ1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Tlr1Q9EPQ1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Tlr1Q9EPQ1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms