Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPN1

Nbea, Neurobeachin, mousemouse

Predictions only

Length 2,936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NbeaQ9EPN1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NbeaQ9EPN1 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NbeaQ9EPN1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NbeaQ9EPN1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NbeaQ9EPN1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NbeaQ9EPN1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NbeaQ9EPN1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NbeaQ9EPN1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NbeaQ9EPN1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NbeaQ9EPN1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NbeaQ9EPN1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NbeaQ9EPN1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NbeaQ9EPN1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NbeaQ9EPN1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NbeaQ9EPN1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NbeaQ9EPN1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NbeaQ9EPN1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NbeaQ9EPN1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NbeaQ9EPN1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NbeaQ9EPN1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NbeaQ9EPN1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NbeaQ9EPN1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NbeaQ9EPN1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NbeaQ9EPN1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NbeaQ9EPN1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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NbeaQ9EPN1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NbeaQ9EPN1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NbeaQ9EPN1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NbeaQ9EPN1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NbeaQ9EPN1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NbeaQ9EPN1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NbeaQ9EPN1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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NbeaQ9EPN1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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NbeaQ9EPN1 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NbeaQ9EPN1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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NbeaQ9EPN1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NbeaQ9EPN1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NbeaQ9EPN1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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NbeaQ9EPN1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NbeaQ9EPN1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NbeaQ9EPN1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NbeaQ9EPN1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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NbeaQ9EPN1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NbeaQ9EPN1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NbeaQ9EPN1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NbeaQ9EPN1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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NbeaQ9EPN1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NbeaQ9EPN1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NbeaQ9EPN1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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NbeaQ9EPN1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NbeaQ9EPN1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NbeaQ9EPN1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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NbeaQ9EPN1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NbeaQ9EPN1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NbeaQ9EPN1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NbeaQ9EPN1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NbeaQ9EPN1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NbeaQ9EPN1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NbeaQ9EPN1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NbeaQ9EPN1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NbeaQ9EPN1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NbeaQ9EPN1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NbeaQ9EPN1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NbeaQ9EPN1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NbeaQ9EPN1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NbeaQ9EPN1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NbeaQ9EPN1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NbeaQ9EPN1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NbeaQ9EPN1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NbeaQ9EPN1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NbeaQ9EPN1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms