Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clstn1Q9EPL2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms