Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc97Q9DBT3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms