Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB91

Med29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med29Q9DB91 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms