Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Med27Q9DB40 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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