Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAR1

Cmtm2a, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2aQ9DAR1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms