Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf138rt1Q9D9M9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf138rt1Q9D9M9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf138rt1Q9D9M9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf138rt1Q9D9M9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Rnf138rt1Q9D9M9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Rnf138rt1Q9D9M9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf138rt1Q9D9M9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf138rt1Q9D9M9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Rnf138rt1Q9D9M9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf138rt1Q9D9M9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf138rt1Q9D9M9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Rnf138rt1Q9D9M9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf138rt1Q9D9M9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf138rt1Q9D9M9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnf138rt1Q9D9M9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnf138rt1Q9D9M9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Rnf138rt1Q9D9M9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Rnf138rt1Q9D9M9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Rnf138rt1Q9D9M9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rnf138rt1Q9D9M9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Rnf138rt1Q9D9M9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rnf138rt1Q9D9M9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Rnf138rt1Q9D9M9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Rnf138rt1Q9D9M9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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