Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp12Q9D9M2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms