Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8W5

Psmd12, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd12Q9D8W5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmd12Q9D8W5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmd12Q9D8W5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmd12Q9D8W5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Psmd12Q9D8W5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Psmd12Q9D8W5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Psmd12Q9D8W5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmd12Q9D8W5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms