Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rexo2Q9D8S4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rexo2Q9D8S4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rexo2Q9D8S4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rexo2Q9D8S4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rexo2Q9D8S4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rexo2Q9D8S4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rexo2Q9D8S4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rexo2Q9D8S4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rexo2Q9D8S4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rexo2Q9D8S4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rexo2Q9D8S4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rexo2Q9D8S4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rexo2Q9D8S4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rexo2Q9D8S4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rexo2Q9D8S4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rexo2Q9D8S4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rexo2Q9D8S4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rexo2Q9D8S4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rexo2Q9D8S4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rexo2Q9D8S4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rexo2Q9D8S4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rexo2Q9D8S4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rexo2Q9D8S4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rexo2Q9D8S4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rexo2Q9D8S4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rexo2Q9D8S4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rexo2Q9D8S4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rexo2Q9D8S4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rexo2Q9D8S4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rexo2Q9D8S4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rexo2Q9D8S4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rexo2Q9D8S4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rexo2Q9D8S4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rexo2Q9D8S4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rexo2Q9D8S4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rexo2Q9D8S4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rexo2Q9D8S4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rexo2Q9D8S4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rexo2Q9D8S4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rexo2Q9D8S4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rexo2Q9D8S4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rexo2Q9D8S4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rexo2Q9D8S4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rexo2Q9D8S4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rexo2Q9D8S4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rexo2Q9D8S4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rexo2Q9D8S4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rexo2Q9D8S4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rexo2Q9D8S4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rexo2Q9D8S4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rexo2Q9D8S4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rexo2Q9D8S4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rexo2Q9D8S4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rexo2Q9D8S4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rexo2Q9D8S4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rexo2Q9D8S4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rexo2Q9D8S4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rexo2Q9D8S4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rexo2Q9D8S4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rexo2Q9D8S4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rexo2Q9D8S4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rexo2Q9D8S4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rexo2Q9D8S4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rexo2Q9D8S4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rexo2Q9D8S4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rexo2Q9D8S4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rexo2Q9D8S4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rexo2Q9D8S4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rexo2Q9D8S4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rexo2Q9D8S4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rexo2Q9D8S4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rexo2Q9D8S4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rexo2Q9D8S4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rexo2Q9D8S4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rexo2Q9D8S4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rexo2Q9D8S4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rexo2Q9D8S4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rexo2Q9D8S4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rexo2Q9D8S4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rexo2Q9D8S4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rexo2Q9D8S4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rexo2Q9D8S4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rexo2Q9D8S4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rexo2Q9D8S4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rexo2Q9D8S4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rexo2Q9D8S4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rexo2Q9D8S4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rexo2Q9D8S4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rexo2Q9D8S4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rexo2Q9D8S4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rexo2Q9D8S4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rexo2Q9D8S4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rexo2Q9D8S4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rexo2Q9D8S4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rexo2Q9D8S4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rexo2Q9D8S4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rexo2Q9D8S4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rexo2Q9D8S4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rexo2Q9D8S4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms