Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms