Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem54Q9D7S1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms