Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmigd1Q9D7L8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms