Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms