Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc3Q9D6Y1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc3Q9D6Y1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms