Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
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Ptp4a3Q9D658 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
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Ptp4a3Q9D658 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
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Ptp4a3Q9D658 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Ptp4a3Q9D658 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Ptp4a3Q9D658 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Ptp4a3Q9D658 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Ptp4a3Q9D658 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Ptp4a3Q9D658 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Ptp4a3Q9D658 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Ptp4a3Q9D658 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Ptp4a3Q9D658 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Ptp4a3Q9D658 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms