Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2E1

Tssk3, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tssk3Q9D2E1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tssk3Q9D2E1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms