Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc6bQ9D289 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms