Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms